營區整體改革后，車輛停放服務和道路交通服務(包括過路費、過橋費、過街費等。)財稅〔2021〕36號附件1規定按照房地產經營租賃服務征收增值稅。房地產經營租賃服務的適用稅率為11%。根據增值稅的特殊計稅方法，上一環節已經繳納的稅額，可以在下一環節扣除，使每個環節形成一個完整的鏈條。
所以正常情況下，我們所獲得的過路費、過橋費、過閘費都要按11%扣除，而上游是免稅的，比如有財政負擔的過路費，下游是不允許扣除的。
但財稅[2021] 3號文附件2《廣州市注冊公司代理費》第6條規定，公路企業普通納稅人可收取試點前已開工高速公路通行費，可選擇適用簡易計稅方法，減按3%的稅率計算應納稅額。
財稅〔2021〕47號規定，一般納稅人在試點前已開工的一級公路、二級公路、橋梁、閘門征收通行費時，可選擇適用簡易計稅方法，按照5%的征收率計算繳納增值稅。
所以有高速低速率和低速高速率的演繹總結。具體來說，就是這樣。
“高速低費率”公路通行費可抵扣進項稅額=公路通行費發票注明的金額÷(1+3%)x3%。
一級公路、二級公路、橋梁、閘門“低速高費率”通行費可抵扣進項稅額=一級公路、二級公路、橋梁、閘門通行費發票注明的金額÷(1+5%)x5%。
至于為什么要計算扣除額，公式是把票面價格改成不含稅價格，乘以扣除率。這很容易理解。事實上，你可以通過觀察你的生活來理解它。
你看我們開車領的過橋費有沒有增值稅專用發票？現實中沒有辦法給你開增值稅專用發票抵扣，這和這個行業的特殊性密切相關。
收費有其特殊性，金額小，開票速度快，排隊車輛不可能提供稅號等待開票。所以我們看到的營改增后的發票，仍然是通用機發票或者通用定額發票。
預付充值
以上是通過人工收費獲得，ETC通過后銀行開具，還是通過預付費獲得。它們的一個共同特點是都是從新的非增值稅發票管理系統中開具的。
至于如何填寫申報表？
中華人民共和國國家稅務總局公告2021年第27號規定:增值稅一般納稅人繳納道路、橋梁、閘門通行費。根據政策，按照收費發票(不含財政票據)上注明的通行費金額計算的可抵扣進項稅額，在《中華人民共和國國家稅務總局公告2021年第13號》附件1第8欄“其他”填寫
截至目前，從2021年1月1日起，道路交通扣除憑證有兩種類型。應該說是一種業務，有兩種不同的扣款方式。
根據《中華人民共和國交通運輸部國家稅務總局公告2021年第66號》規定，增值稅一般納稅人抵扣通行費電子發票的進項稅額，在填報納稅申報表時，應填寫《增值稅納稅申報表附列信息(二)》(本期進項稅額明細)中“有證明符合性的增值稅專用發票”相關欄目。
即與專票的填寫位置相同，必須進行核對認證。核對成功后，根據統計表填寫申報表。
按照現行政策，納稅人已繳納的收費公路通行費增值稅電子普通發票尚未取得，可憑取得的通行費發票計算抵扣至2021年6月30日。
對于納稅人已繳納的一類、二類公路通行費，如果尚未取得收費公路通行費增值稅電子普通發票，可根據取得的通行費發票上注明的通行費金額計算扣除并執行至2021年12月31日。
納稅人支付的橋梁、閘門通行費，暫按取得的通行費發票上注明的通行費金額扣除。
結論:我們可以預見這一趨勢，即所有通行費發票將盡快納入新系統，并通過電子發票開具和抵扣。那么6月30日后獲得的高速公路紙質發票可以抵扣嗎？我們得拭目以待。
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