2015年10月實行“三證合一”，2016年10月實行“五證合一”。此時，如果納稅人的營業執照或稅務登記發生變更，需要到當地工商行政管理部門辦理變更。如有變更，由工商行政管理部門收繳原稅務登記證，核發“一證一碼”營業執照，新證號由15位變更為18位。所以納稅人還需要去其他部門辦理相關事宜。辦理事項和變更稅務登記證號的事項主要包括以下內容。
第一、發變更稅務登記號(稅務部門)
已取得“一照一碼”登記證(照)的納稅人，應及時到稅務機關進行確認和變更。
由于很多納稅人都有稅控設備，為了保證稅控設備和稅務登記號的一致性，納稅人五證合一后，國稅部門不會自動更換新號碼，而是需要納稅人到國稅廳更換稅務登記號。目前，未在國稅辦理過任何發票的企業，可以通過一次通過的方式登錄網上辦稅服務廳變更稅務登記號。而已經國稅批準的企業，只能去國稅服務大廳變更稅務登記號。
建議納稅人在月初完成申報后變更稅務登記號。
文件中規定，納稅人的國稅、地稅任何一個稅務機關在變更登記后都會與對方稅務機關共享信息，但需要納稅人確認，因此納稅人還需要到當地辦稅服務廳確認稅務登記號變更。
第二、國稅變更稅務登記號的具體流程
1.小型免稅設備：變更月份(季度)月初完成納稅申報和抵扣；
2.小型稅控設備
形容詞（adjective的縮寫）變更前一個月(季度)開具所有發票，變更月初至變更結束不購買或開具發票。
B.變更月(季)初完成復印、報稅、清卡、抵扣。
3.大多數人都有稅控設備。
形容詞（adjective的縮寫）系統無法在變更當月自動查舊，所有發票都是在變更前一個月開具。從變更月初至變更結束，不會購買或開具任何發票。
B.變更月初完成復印、報稅、清卡、扣款。
碳（carbon的縮寫）納稅人取得的購買方稅務登記證號為舊稅號的抵扣聯。請在更改前認證并扣除。換了新號碼后可能認證不了，需要換票。
D.納稅人取得的紅字信息表尚未開具紅字發票的，應及時開具紅字發票，更換新稅號后不再開具。
E.納稅人在輔導期內，“先比對后抵扣”海關繳款書、發票或舊號期內上傳的海關繳款書，應在結果返回確認抵扣后辦理變更手續。
氟（fluorine的縮寫）納稅人只能在稅控變更后的次日(注意開票日期)取得新的18位稅號抵扣聯，否則無法通過認證。
沒有發票的納稅人可以在網上大廳更改號碼：
納稅人來辦稅服務廳辦理換號：一本通登錄網上辦稅服務廳，選擇稅務登記模塊，點擊“三證(五證)一換”，點擊“我要提交新申請”，點擊填表。手工新增社會信用代碼時，注意確保與新營業執照上的社會信用代碼一致。一定要區分大小寫，注意不要有空格。點擊“添加附件”上傳附件(務必上傳營業執照原件的新彩照，分支機構需同時上傳總公司營業執照原件的原彩照)。驗收完成并通過后，處理程序
開立銀行賬戶時，需要登記稅務登記證號。號碼升級后，要終止舊的稅、庫、行三方協議，按照新的18位號碼重新簽訂新的稅、庫、行三方協議。為方便納稅人，可使用原15位數字登錄網絡大廳直接解除協議。注冊號變更后，電子三方協議可在網廳一本通變更后直接簽訂。現在北京銀行和工商銀行都實現了電子簽約，連銀行都不用跑了。
原有的三方協議在部分企業變更注冊號后仍然有效，因為企業在銀行留下的稅務注冊號沒有變更，但在銀行的稅務注冊號發生變更時，必須重新簽訂三方協議。企業變更注冊號后，不能直接在網廳注銷三方協議，需要在辦稅服務廳注銷三方協議。
第三、銀行信息變更，重新簽署“稅銀聯網三方協議”(銀行系統)
要求在專用發票上刻制稅務登記證號。編號升級后，納稅人應及時申請刻制印章。另外，一些單位的其他印章也可能涉及稅號變更，比如合同專用章，請務必及時更換。
第四、重新刻制“發票專用章”(公安部門)
納稅人還得去稅號和營業執照號涉及的其他部門逐一更改稅號和營業執照。請不要遺漏它。
